Сделайте все правильно! Нормы пп. 140.5.1 и 140.5.2 НК применяются только по результатам налогового (отчетного) года. Поэтому не важно, в каком квартале отчетного года у вас были контролируемые операции, по которым вы проводите самостоятельную корректировку по правилам пп. 39.5.4.1 НК. В любом случае такая корректировка отражается только в декларации за этот год в целом.